Năm 1992, Viện Tim TPHCM được thành lập với sự hợp tác của Hiệp hội Alain Carpentier của Pháp và đồng sáng lập là cố Viện sĩ, Tiến sĩ, Bác sĩ Dương Quang Trung - nguyên Giám đốc Sở Y tế TPHCM. Sau 24 năm hoạt động, đến nay Viện trở thành trung tâm tim mạch lớn thứ hai trong khu vực (sau Malaysia).
Từ khi thành lập đến nay, Viện Tim đã phẫu thuật gần 25.000 bệnh nhân mắc bệnh tim bẩm sinh và các bệnh lí về tim khác như hở van tim, suy tim, hẹp động mạch vành...
Năm 2015, Viện Tim cũng đã đưa vào hoạt động Khu kỹ thuật mới được trang bị những thiết bị y tế hiện đại nhất trong lĩnh vực giải phẫu tim mạch và phòng thông tim can thiệp để kịp thời cấp cứu, xử trí những ca cấp cứu bệnh nhân bị bệnh mạch vành.