Do ảnh hưởng của dịch bệnh dẫn đến việc các giải đấu quốc tế đều bị hoãn hoặc hủy, Công Phượng chỉ thi đấu trong màu áo ĐT Việt Nam duy nhất một trận trong năm 2020. Đó là trận giao hữu với U22 Việt Nam ngày 27/12 tại SVĐ Việt Trì (Phú Thọ).
Trong ngày được vợ đến sân cổ vũ, Công Phượng lại bỏ lỡ một số cơ hội khá đáng tiếc trong trận đấu duy nhất ra sân trong màu áo ĐT Việt Nam năm 2020.
