Lý do là website chùa Ba Vàng hoạt động như một trang thông tin điện tử tổng hợp nhưng chưa có giấy phép của cơ quan quản lý nhà nước.Tại buổi làm việc vừa qua giữa Sở Thông tin - Truyền thông với Ban trị sự chùa Ba Vàng liên quan đến những website này, trụ trì chùa cho rằng đây là trang thông tin nội bộ của nhà chùa.
Tuy nhiên qua kiểm tra thực tế, trang này có trích dẫn một số thông tin từ nguồn khác và hoạt động như một trang thông tin điện tử nhưng lại chưa đăng ký xin cấp phép của cơ quan chức năng.
Ảnh chụp màn hình giao diện website chùa Ba Vàng trưa 25/3/2019
Ngoài ra, 2 trang website cá nhân của trụ trì Thích Trúc Thái Minh với tên miền thichtructhaiminh.com và của bà Phạm Thị Yến là phamthiyen.com đã sử dụng tên miền quốc tế (.com) nhưng không thông báo với Bộ Thông tin - Truyền thông.
Hiện các website này đều đã tạm dừng hoạt động hoặc ở tình trạng không truy cập được.