Qua kết luận, Bộ đình chỉ tuyển sinh năm 2012 đối với 3 trường là ĐH Văn Hiến, ĐH Đông Đô, CĐ Công nghệ Thông tin TPHCM do chưa có đất hoặc diện tích đất quá nhỏ, tỷ lệ SV/ Giảng viên cơ hữu quá cao, đồng thời đình chỉ tuyển sinh 12 ngành thuộc 4 trường là ĐH Chu Văn An, ĐH Lương Thế Vinh, ĐH Nguyễn Trãi, ĐH Kiến Trúc Đà Nẵng.
Trong 24 trường kiểm tra đợt này có 10 trường có dưới 100 GV cơ hữu và hợp đồng, có 6 trường có trên 50 SV/Giảng viên. Một số trường công lập tuyển sinh vượt quá quy mô cam kết. Đặc biệt có hơn 40 ngành không có giảng viên trình độ tiến sĩ, 12 ngành không có tiến sĩ, thạc sĩ, thậm chí có ngành chưa có Giảng viên cơ hữu. Ngoài ra, Bộ cũng ban hành văn bản cảnh báo các trường chưa xây dựng được cơ sở vật chất là ĐH Hoà Bình, ĐH Chu Văn An, ĐH Kinh Tế tài chính TPHCM và ĐH Quốc Tế Sài Gòn. Về việc thanh tra hoạt động liên kết đào tạo, Bộ cũng đưa ra quyết định xử phạt vi phạm hành chính trong lĩnh vực giáo dục đối với công ty TNHH dạy nghề đào tạo quốc tế Raffles (75 triệu đồng), công ty TNHH nghiên cứu và giáo dục VN ERC VN (80 triệu đồng) và công ty TNHH Ila VN (65 triệu).