Ngày 16/12, Cơ quan an ninh điều tra Công an TPHCM đã ra quyết định khởi tố vụ án, khởi tố bị can và khám xét nơi ở, nơi làm việc với ông Diệp Dũng về tội “lạm quyền trong khi thi hành công vụ” và thi hành lệnh bắt bị can để tạm giam. Các quyết định, lệnh của cơ quan điều tra đã được Viện kiểm sát nhân dân TPHCM phê chuẩn.
Trước đó, ngày 30/7, Ban thường vụ Thành ủy TPHCM đã kỷ luật đình chỉ sinh hoạt cấp ủy tại Saigon Co.op đối với ông Diệp Dũng.
Ngày 27/7, Thanh tra TPHCM đã công bố kết luận thanh tra về các sai phạm tại Saigon Co.op. Kết luận của thanh tra chỉ rõ việc tăng vốn điều lệ tại Saigon Co.op không đúng quy định pháp luật, có dấu hiệu thâu tóm, chiếm đoạt vốn, xâm phạm đến quyền sở hữu tài sản chung và tài sản nhà nước, ảnh hưởng đến an ninh kinh tế của TPHCM nói riêng và cả nước nói chung; có dấu hiệu phạm pháp hình sự.
Cùng ngày 27/7/2020, Ủy ban kiểm tra Thành ủy TPHCM đã triển khai quyết định đình chỉ sinh hoạt cấp ủy đối với ông Diệp Dũng - thành ủy viên và đình chỉ các vai trò ban chấp hành, ban thường vụ và bí thư Đảng ủy của ông Diệp Dũng tại Đảng bộ Saigon Co.op.
Ủy ban kiểm tra Thành ủy xác định ông Diệp Dũng đã tổ chức chỉ đạo huy động tăng vốn trái pháp luật, tổ chức đại hội thường niên trái pháp luật và thực hiện công tác cán bộ trái quy định của Đảng và không trung thực với tổ chức khi có yêu cầu báo cáo.
Chiều 3/11, tại cuộc họp báo về tình hình kinh tế, văn hóa xã hội tháng 10, bà Nguyễn Thị Hồng Thắm, Phó giám đốc Sở Nội vụ cho biết, Sở này đã có tờ trình gửi UBND TP.HCM về quy trình miễn nhiệm chức vụ chủ tịch hội đồng quản trị Saigon Co.op của ông Diệp Dũng.
“Hiện nay, ông Diệp Dũng đã chuyển công tác về Công ty Xổ số kiến thiết TP. Công việc cụ thể của ông Dũng do ban lãnh đạo công ty này quyết định”, bà Thắm cho biết.
Trước đó, ông Diệp Dũng được Thành ủy TPHCM chỉ định tham gia ban chấp hành Đảng bộ, ban thường vụ Đảng ủy, giữ chức bí thư Đảng ủy Saigon Co.op nhiệm kỳ 2015-2020 và giới thiệu bầu giữ chức chủ tịch HĐQT Saigon Co.op từ cuối tháng 8/2015.