Khen đã 2 lần nhặt được đạn tại bãi rác sân bay Phú Quốc cũ và mang về nhà cất giữ với mục đích bán phế liệu.
Theo cáo trạng, vào năm 2021, trong lúc đi nhặt phế liệu tại bãi rác sân bay Phú Quốc cũ (phường Dương Đông, TP Phú Quốc), Nguyễn Thanh Khen phát hiện 19 viên đạn. Ông đã đem số đạn này về nhà cất giữ với mục đích bán phế liệu.
Đến tháng 9/2022, cũng tại địa điểm này, Khen tiếp tục nhặt được một thùng sắt bên trong chứa 151 viên đạn và một còng số 8. Lần này, ông cũng mang tất cả về nhà với ý định tương tự.
Ngày 23/7/2024, khi bị Công an phường Dương Đông phát hiện sử dụng trái phép chất ma túy, Nguyễn Thanh Khen đã tự nguyện giao nộp 151 viên đạn cùng còng số 8 với hy vọng lập công chuộc tội.
Tuy nhiên, xét thấy vụ việc có nhiều tình tiết phức tạp, Công an TP Phú Quốc đã tiến hành khám xét khẩn cấp nơi ở của Khen. Qua đó, cơ quan chức năng phát hiện và thu giữ thêm 19 viên đạn và một hộp tiếp đạn súng AR15.
Theo kết luận giám định, toàn bộ 170 viên đạn thu giữ từ Nguyễn Thanh Khen đều là vũ khí quân dụng. Sau quá trình điều tra, ông Khen bị khởi tố và bắt tạm giam về hành vi "Tàng trữ trái phép vũ khí quân dụng".
Ngày 17/1/2025, tại phiên tòa sơ thẩm, Tòa án nhân dân tỉnh Kiên Giang đã tuyên phạt Nguyễn Thanh Khen mức án 2 năm tù giam.