Theo Trung tâm Bão quốc gia Mỹ, Rafael dự kiến sẽ tăng cường độ trước khi đổ bộ vào ngày 6/11, với sức gió tối đa có thể lên tới 160 km/giờ.
Bão Rafael có khả năng tiến sát thủ đô La Habana, gây ra nguy cơ thiệt hại nghiêm trọng cho nhà ở và cơ sở hạ tầng trong khu vực. Các chuyên gia cũng cảnh báo về hiện tượng triều cường và sóng lớn nguy hiểm, đặc biệt tại Quần đảo Cayman, mặc dù chưa thể xác định mức độ ảnh hưởng đến Mỹ.
Trước mối đe dọa từ Rafael, nhà chức trách Cuba đã nhanh chóng triển khai biện pháp phòng chống. Hơn 66.000 cư dân ở tỉnh Guantanamo, nơi dự kiến có mưa lớn và nguy cơ lũ lụt, đã được sơ tán. Đây là khu vực có kết cấu đất yếu, vốn chịu nhiều tổn hại từ đợt lũ do bão Oscar vừa qua. Hàng ngàn người ở tỉnh Pinar del Rio, phía Tây Cuba, cũng đang chuẩn bị kế hoạch sơ tán khẩn cấp.
Một số tỉnh tại Cuba đã tạm dừng các hoạt động giáo dục và giao thông để đảm bảo an toàn. Bộ Giao thông Cuba đã ra lệnh dừng hoạt động một số tuyến xe buýt và đường sắt để tránh rủi ro khi bão Rafael tiến gần.
Tính đến 7 giờ sáng 5/11 (giờ Việt Nam), Rafael đang ở cách Kingston, Jamaica khoảng 230 km về phía Nam, với sức gió mạnh nhất liên tục đạt 75 km/giờ. Đây là cơn bão thứ 17 được đặt tên trong mùa bão Đại Tây Dương năm nay, nơi trung bình mỗi năm đón nhận 14 cơn bão lớn.