Trong năm 2013, Cục đã phát hiện và bắt giữ 6.517 vụ vi phạm buôn lậu và gian lận thương mại , vận chuyển hàng cấm với tổng số tiền xử phạt vi phạm lên đến hơn 101 tỷ đồng.
Cũng trong năm 2013, Cục Hải quan TP đã thực hiện hoàn thành vượt mức chỉ tiêu về thu nộp ngân sách với tổng số tiền hơn 76.815 tỷ đồng, đạt gần 107%, thu hồi và xử lý nợ thuế tồn đọng hơn 1.007 tỷ đồng.
Với những thành tích đạt được trong năm 2013, Cục Hải quan TP vinh dự được Chủ tịch nước trao tặng huân chương lao động hạng BaI.

