Thông quan tự động theo hệ thống Vnaccs/Vcis là một phần trong khuôn khổ dự án “Xây dựng, triển khai Hải Quan điện tử và thực hiện cơ chế Hải Quan một cửa quốc gia phục vụ hiện đại hóa Hải Quan Việt Nam” được Bộ Tài chính Việt Nam và Cơ quan Hợp tác Quốc tế Nhật Bản (JICA) ký kết ngày 22/3/2011. Hệ thống đã được bàn giao chính thức cho chính phủ Việt Nam vào ngày 25/4/2014.
Ngoài ưu điểm là tiếp nhận thông tin và thông quan hoàn toàn tự động, xử lý tập trung ở cả 3 khâu: trước, trong, sau thông quan, hệ thống Vnaccs/Vcis sẽ giúp tăng cường kết nối với các Bộ, Ngành bằng cách áp dụng Cơ chế một cửa, thông tin liên quan đến việc cấp phép của các cơ quan chuyên ngành. Thời gian thông quan hàng hóa được rút ngắn tối đa với sơ đồ xử lý thông tin luồng xanh, luồng vàng và luồng đỏ. Một chức năng khác của Hệ thống Vnaccs/vcis, đó là thực hiện kết nối 1 cửa ASEAN.
Để thông quan hàng hóa tự động theo hệ thống này, trước đó, Cục Hải quan TP đã tổ chức tập huấn cho 3.000 doanh nghiệp và tổ chức cho doanh nghiệp thông quan thử nghiệm cũng như trang bị thêm hệ thống máy tính, đường truyền cáp quang nhằm đảm bảo cho hệ thống được thông suốt.
Từ nay đến 30/6, chương trình sẽ được triển khai đồng bộ tại tất cả 12 chi cục.

