Tuy nhiên, không ít ý kiến thắc mắc về tính cấp thiết của các dự án này. Đại biểu Nguyễn Mạnh Cường, đoàn Quảng Bình cho rằng, thẩm quyền quyết định ngân sách của Quốc hội vẫn còn hình thức. Nguyên nhân là do cách làm chưa hợp lý. Tại kỳ họp thứ 2 cách đây vài tháng Quốc hội đã thông qua nghị quyết không bổ sung thêm danh mục dự án mới giai đọan 2012-2015, bây giờ lại bổ sung thêm 5 dự án nêu trên. Vậy thì sau này có bổ sung nữa không. Ở Việt Nam có nhiều dự án rất quan trọng cần xây dựng, đã được phê duyệt nhưng không bố trí vốn. Việc chọn bổ sung 5 dự án này căn cứ vào tiêu chí gì.
Một số đại biểu còn đặt vấn đề về tính minh bạch trong việc phân bổ nguồn vốn trái phiếu chính phủ. Theo nghị quyết của Quốc hội, trong vòng 5 năm tới sẽ huy động bằng trái phiếu Chính phủ 225 ngàn tỷ đồng, nếu chia cho 63 tỉnh thành thì mỗi địa phương được hơn 3 ngàn tỷ nhưng thực tế có tỉnh được phân bổ rất nhiều trong khi một số tỉnh khác thì chẳng có đồng nào, vậy phải chăng có hiện tượng xin cho ở đây. Bên cạnh các ý kiến không đồng tình thì đa số đại biểu đồng tình với việc bổ sung 5 dự án vừa nêu. Đại biểu Danh Út, đoàn Kiên Giang phân tích, thực chất bà con Khơ me không có điều kiện đi học do đó nên đầu tư ký túc xá ở Trà Vinh để tạo điều kiện cho bà con Khơ me đi học là chuyện cần thiết và mang tích cấp bách. Còn đây là ý kiến của đại biểu Nguyễn Thị Khá, đoàn Trà Vinh,
Đại biểu Huỳnh Thế Kỳ, đoàn Ninh Thuận cho rằng, chúng ta nên nghĩ đến yếu tố chính trị to lớn của dự án này. Đại biểu Kỳ nói:
Theo đại biểu Nguyễn Ngọc Bảo, Vĩnh Phúc, chúng ta không thể cứng nhắc. Dù Quốc hội đã có nghị quyết không bổ sung nguồn vốn trong 5 năm tới, nhưng nếu cần thiết có thể bổ sung, thậm chí 1 -2 năm cũng có thể điều chỉnh để đáp ứng nhu cầu thực tế phát triển của đất nước. Nhiều ý kiến cũng cho rằng, bổ sung thêm 3 dự án giao thông là cần thiết. Vấn đề là phải thực hiện cho có hiệu quả. Đại biểu Trần Du Lịch, đoàn TPHCM kiến nghị, liên quan đến 3 dự án giao thông tôi rất đồng tình nhưng chất lượng của nhiều công trình kém, kinh phí cao, thất thoát nhiều. Quốc hội cần có chuyên đề đánh giá nghiêm túc thực trạng này. Đại biểu Trần Du Lịch nói:
Giải trình trước Quốc hội Bộ trường Bộ Kế hoạch Đầu tư Bùi Quang Vinh khẳng định, không có chuyện xin cho ở đây. Việc bổ sung 5 dự án này là đúng với quy định. Chiều nay, Quốc Hội thảo luận ở Hội trường về Dự án Luật dự trữ Quốc gia.
