Nhiều khả năng bão và áp thấp nhiệt đới trên khu vực Biển Đông vẫn sẽ xuất hiện nhiều hơn so với trung bình nhiều năm (trung bình nhiều năm khoảng 12 đến 13 cơn/năm), nhưng số lượng bão và áp thấp nhiệt đới ảnh hưởng trực tiếp đến đất liền nước ta sẽ ít hơn trung bình nhiều năm (trung bình nhiều năm khoảng 5 đến 6 cơn).
Ngoài ra, tính bất quy luật của bão sẽ tăng cao vào những năm chịu tác động của El Nino. Mùa mưa ở Bắc Bộ đến muộn hơn trung bình nhiều năm. Thời điểm bắt đầu mùa mưa ở Nam Bộ và Tây Nguyên có khả năng đến sớm hơn trung bình nhiều năm.
Dưới tác động của El Nino vào cuối năm, lượng mưa trên phạm vi toàn quốc có xu hướng thiếu hụt so với trung bình nhiều năm vào cuối mùa mưa năm 2017. Tuy nhiên, hiện tượng mưa lớn, đến rất lớn cục bộ trong thời đoạn ngắn thường xuất hiện trong những năm chịu tác động của El Nino.
Mùa lũ 2017 trên các sông ở Tây Nguyên và thượng nguồn sông Mê Kông đến sớm hơn so với trung bình nhiều năm. Diễn biến lũ trên các sông ở Trung Bộ và sông Cửu Long phù hợp với quy luật nhiều năm, đỉnh lũ trên các sông ở Trung Bộ, Tây Nguyên tương đương mức trung bình nhiều năm.
Lũ lớn nhất năm ở đồng bằng sông Cửu Long ở mức báo động 2 - báo động 3. Tuy ít có khả năng xuất hiện lũ đặc biệt lớn nhưng tiềm ẩn nguy cơ cường suất lũ lên nhanh hơn bình thường do tác động của việc xả ở thượng lưu.
