Trong đó, Chủ tịch Công ty Cổ phần Tập đoàn Thái Dương, Đoàn Văn Huấn, bị đề nghị truy tố về ba tội danh: “Vi phạm quy định về thăm dò, khai thác tài nguyên,” “Vi phạm quy định về kế toán gây hậu quả nghiêm trọng” và “Gây ô nhiễm môi trường.”
Ngoài Đoàn Văn Huấn, vụ án còn liên quan đến nhiều cán bộ cấp cao tại Bộ Tài nguyên và Môi trường.
Cựu Thứ trưởng Bộ Tài nguyên và Môi trường, Nguyễn Linh Ngọc, bị đề nghị truy tố về tội “Vi phạm quy định về quản lý, sử dụng tài sản Nhà nước gây thất thoát, lãng phí.”

Các bị can khác thuộc Bộ Tài nguyên và Môi trường, bao gồm Nguyễn Văn Thuấn (cựu Tổng cục trưởng Tổng cục Địa chất và Khoáng sản) và Hoàng Văn Khoa (cựu Vụ trưởng Vụ Khoáng sản), cũng bị đề nghị truy tố tội danh tương tự.
Đặc biệt, Hồ Đức Hợp, cựu Giám đốc Sở Tài nguyên và Môi trường tỉnh Yên Bái, cũng bị đề nghị truy tố với cáo buộc "Vi phạm quy định về quản lý, sử dụng tài sản Nhà nước gây thất thoát, lãng phí."
Theo kết luận điều tra, vụ án bắt đầu từ năm 2013 khi một số lãnh đạo và cán bộ tại Bộ Tài nguyên và Môi trường có hành vi vi phạm trong việc cấp phép khai thác khoáng sản cho Công ty Thái Dương.
Mặc dù Công ty Thái Dương không đáp ứng đủ điều kiện, nhóm cán bộ thuộc Tổng cục Địa chất và Khoáng sản vẫn đề xuất và để cựu Thứ trưởng Nguyễn Linh Ngọc ký cấp giấy phép khai thác.
Cựu Thứ trưởng Nguyễn Linh Ngọc khẳng định không nhận lợi ích cá nhân từ Đoàn Văn Huấn nhưng thừa nhận hành vi của mình đã góp phần khiến Công ty Thái Dương khai thác trái phép đất hiếm, gây thiệt hại hơn 864 tỷ đồng.
Ngược lại, Nguyễn Văn Thuấn khai nhận đã nhận 500 triệu đồng từ Đoàn Văn Huấn như một lời cảm ơn.
Sau khi nhận giấy phép, Công ty Thái Dương không thực hiện đúng các quy định về khai thác, đặc biệt là việc không tinh luyện quặng đất hiếm trước khi bán, mà tiêu thụ quặng thô.
Sở Tài nguyên và Môi trường tỉnh Yên Bái, mặc dù biết các vi phạm của công ty, nhưng không có biện pháp thanh tra, kiểm tra hay xử lý.
Đến năm 2021, khi Công ty Thái Dương xin gia hạn giấy phép khai thác, Hồ Đức Hợp khi đó là Giám đốc Sở Tài nguyên và Môi trường tỉnh Yên Bái đã báo cáo không trung thực, che giấu sai phạm của doanh nghiệp để công ty tiếp tục khai thác trái phép.
Vụ án này tiếp tục gây sự chú ý lớn về việc quản lý, giám sát các hoạt động khai thác khoáng sản và trách nhiệm của các cơ quan, tổ chức trong việc ngăn chặn các hành vi vi phạm pháp luật. Các bị can trong vụ án đều sẽ đối diện với các tội danh nghiêm trọng, liên quan đến thất thoát tài sản Nhà nước và gây ô nhiễm môi trường.