Tướng Lee, cùng với cựu Bộ trưởng Quốc phòng Kim Yong-hyun và Tư lệnh Cơ quan Tình báo Quân đội Yeon In-hyung, là những nhân vật chủ chốt bị cáo buộc có liên quan đến các hành động quân sự trong thời gian diễn ra thiết quân luật.
Cuộc điều tra này nhằm làm rõ các hoạt động của quân đội, đặc biệt là việc triển khai lực lượng đặc nhiệm và cảnh sát quân sự vào Quốc hội Hàn Quốc nhằm ngăn chặn các nghị sĩ bỏ phiếu bác bỏ lệnh thiết quân luật. Tướng Lee bị cáo buộc tội danh nổi loạn và lạm quyền sau khi từ chối tham gia điều tra mà không có lý do chính đáng. Ông bị nghi ngờ có thể tiêu hủy bằng chứng hoặc bỏ trốn.
Trong một cuộc phỏng vấn, tướng Lee cho biết vào sáng sớm 4/12, Tổng thống Yoon Suk Yeol đã gọi điện hỏi về tình hình, và ông đã thông báo rằng quân đội không thể di chuyển lực lượng vì tình hình phức tạp. Mặc dù tướng Lee cho biết các lực lượng được triển khai không mang theo vũ khí, hình ảnh từ truyền thông cho thấy quân đội đã mang theo đạn thật, tạo ra nhiều tranh cãi về khả năng sử dụng vũ khí trong cuộc đối đầu này.
Sau khi điều tra, Bộ Quốc phòng đã đình chỉ chức vụ của tướng Lee và cấm ông xuất cảnh. Cơ quan công tố cũng tiến hành khám xét nhà riêng của ông và các nơi liên quan đến lực lượng phòng vệ. Trong vòng 48 giờ tới, cơ quan công tố sẽ xin lệnh bắt giữ chính thức đối với tướng Lee.
Cùng ngày, Tòa án quận trung tâm Seoul đã phát lệnh bắt giữ đối với ông Cho Ji-ho, Ủy viên Tổng cục Cảnh sát Quốc gia, và ông Kim Bong-sik, Giám đốc Cảnh sát Thủ đô Seoul.
Họ bị cáo buộc đóng vai trò chủ chốt trong cuộc nổi loạn liên quan đến lệnh thiết quân luật của Tổng thống Yoon. Các cáo buộc cho rằng ông Cho và ông Kim đã tham gia vào quá trình lập kế hoạch lệnh thiết quân luật và ngăn chặn các nghị sĩ tại Quốc hội.