Bệnh viện này được xây dựng trong khu Viện-Trường y tế kỹ thuật cao Đại học Y khoa Phạm Ngọc Thạch.
Khu vực Viện–Trường này gồm một trường đại học và các bệnh viện đa khoa, chuyên khoa quy mô 3.600 giường bệnh.
Lễ khởi công xây dựng cơ sở 2 - Bệnh viện Truyền máu Huyết học
Theo thiết kế, bệnh viện có 5 tầng với 300 giường bệnh, diện tích sàn xây dựng hơn 33.000m2. Bên cạnh khu khám điều trị bệnh, ghép tế bào gốc là các khối nhà phụ trợ. Bệnh viện cũng phục vụ công tác truyền máu, lưu trữ máu cho ngành y tế thành phố.
Hiện tại, Bệnh viện Truyền máu Huyết học cơ sở 1 mỗi ngày tiếp nhận khoảng 500 lượt khám chữa bệnh ngoại trú, gần 200 giường bệnh nội trú nhưng luôn trong tình trạng quá tải.
