Đây là trường công lập hoạt động theo cơ chế tự chủ tài chính toàn phần với hơn 1.200 học sinh, 100% học 2 buổi 1 ngày.
Nhà trường tổ chức bếp ăn tại chỗ phục vụ ăn sáng, trưa và xế đảm bảo dinh dưỡng cho học sinh cả ngày ở trường.
Năm học 2014-2015 trường có 100% học sinh hoàn thành bậc tiểu học, 93% học sinh THCS đậu vào trường THPT công lập, 90% học sinh THPT đậu đại học.
Tại buổi làm việc, trường TH-THCS-THPT Nam Sài Gòn cho biết mức thu học phí hiện hành áp dụng từ năm 1997 đến nay đã lạc hậu và kiến nghị tăng mức học phí ở bậc tiểu học từ 400.000 đồng lên mức 1,2 triệu đồng/học sinh/tháng, bậc THCS và THPT từ 600.000 đồng lên mức 1,6 triệu đồng/học sinh/tháng, đảm bảo nguyên tắc thu đủ bù chi.