Theo đó, Phó chủ tịch UBND Thành phố yêu cầu trong tháng 4/2024, Sở Giáo dục và Đào tạo trình Đề án tổ chức lại trường THPT chuyên Trần Đại Nghĩa trên cơ sở tách trường THPT chuyên Trần Đại Nghĩa thành trường THPT chuyên Trần Đại Nghĩa và trường THCS và THPT Trần Đại Nghĩa có tư cách pháp nhân riêng.
Trong đó, trường THPT chuyên Trần Đại Nghĩa tiếp tục tổ chức và hoạt động của trường chuyên theo quy định, có trụ sở trường đặt tại địa chỉ Lô P2 Khu tái định cư 38,4 ha, phường An Khánh, TP Thủ Đức.
Trường THCS và THPT Trần Đại Nghĩa tổ chức và hoạt động theo quy định tại Điều lệ trường trung học cơ sở, trường THPT và trường phổ thông có nhiều cấp học. Trụ sở trường đặt tại địa chỉ số 53 Nguyễn Du, phường Bến Nghé, Quận 1.
Phó Chủ tịch UBND Thành phố yêu cầu, đề án cần cụ thể lộ trình chia tách trường, giải quyết các vấn đề liên quan đến công tác nhân sự, tài chính, chuyên môn để đảm bảo 2 trường đủ điều kiện vận hành hiệu quả, duy trì truyền thống và chất lượng giáo dục, ổn định tâm lý viên chức, người lao động, học sinh và phụ huynh của nhà trường.